De relatie tussen stikstof en Natura 2000-gebieden is complex. Stikstof is een essentieel voedingselement voor planten, maar overmatige hoeveelheden ervan kunnen problematisch zijn. Wanneer er te veel stikstof in het milieu komt, meestal door landbouwactiviteiten, verkeer en industrie, kan dit leiden tot ‘eutrofiëring’. Dit proces zorgt voor overmatige groei van bepaalde plantensoorten, wat ten koste gaat van de biodiversiteit en de unieke habitats in Natura 2000-gebieden.